在凭保函交付货物的情况下，收货人保证在收到提单后立即向船公司交回全套正本提单，承担应由收货人支付的运费及其他费用的责任，对因未提交提单而提取货物所产生的一切损失均承担责任，并表明对于保证内容由银行与收货人一起负连带责任。凭保函签发提单则使得托运人能以清洁提单、已装船提单顺利地结汇。
预留金保函：又称留滞金担保，是指应承包方（申请人）的请求，向工程业主（受益人）保证，在承包方（申请人）提前支取合同价款中尾欠部分款项而不能按期归还时，由银行负责返还担保函规定金额的预留金款项。通常为合同价款的5%-10%。
保证是民法上的责任，是区别于物保的人的担保，是第三人和债权人约定，当债务人不履行或者不能履行其债务时，该第三人按照约定或法律规定履行债务或者承担责任的担保方式，分为一般保证和连带保证；保函是国际经济法上的责任，国际海上货物运输在《汉堡规则》中规定，托运人为了换取清洁提单可向承运人出具保函，保函只在托运人与承运人之间有效。我国海商法没有关于保函的规定，实践中参照以上规定。
预付款保函如何避免风险?
1、常见生效条款：开立之日起生效;指定日期生效;指定事件生效。
2、常见失效条款：指定失效日期;指定失效事件。
不利的失效条款：事实性条款;不延期即付款或自动延期。
3、减额条款：如：保函金额随xx合同项下履行金额递减;或随验收金额递减。
应尽量采用：随申请人提交的每批货物的提单/发票按比例递减;随申请人提交的由受益人签署的验收证书金额递减。
4、金额敞口风险：赔付利率不明确、赔付币种与担保币种之间汇率不明确、承担无上限律师费和诉讼费等。
5、索赔条款：尽量避免索赔条款过于简单，给受益人不当索赔提供了便利，也可以增加索赔声明的内容。
6、转让风险：受益人要求保函项下的权利可单独转让的。增加了受益人索赔的不确定性，通常情况下应避免。