昆山市的POS机申请方法步骤如下：

1. 按照当地银行要求提供相关证件资料，包括营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人身份证件等；

2. 通过银行柜台或网上银行等渠道，向银行提交POS机申请表和资料；

3. 银行会对申请材料进行审核和核实，如有不符要求的地方将通知申请人进行修改和补充；

4. 申请审核通过后，银行将发放POS机，并对使用方法和相关费用进行说明；

5. POS机安装上线后，申请人需要使用银行提供的相关软件进行操作和管理。

需要注意的是，在申请POS机前，需要先开立银行账户，并确保企业的营业执照、税务登记证和组织机构代码证等证件已经办理齐全。另外，不同服务商的申请流程和所需材料可能有所不同，建议在申请前详细了解服务商的具体要求。

商户在查询POS机费率时可以通过多种途径获取信息。一种方式是直接联系POS机服务商，咨询他们的费率政策。服务商会根据商户的具体情况提供相应的费率方案，商户可以根据自己的需求和经营状况选择合适的POS机费率。

在进行POS机费率比较时，商户需要考虑多个因素。首先是费率的具体数值，不同服务商的费率可能会有较大的差异。商户应该根据自己的交易金额和预期交易笔数来计算费率对经营成本的影响，选择一个合理的费率。